公司缴纳社保的方式为：开通社保账户，在成立之日起三十日内去社保局办理社保开户，社保开户后会领取《社保登记证》。之后确认代缴基数，在与银行、第三方代缴机构签订了代缴协议的情况下，社保费用会每月直接从账户扣除。也可以在电子税务局进行缴纳。

法律依据：

《《中华人民共和国社会保险法》》第十条

职工应当参加基本养老保险，由用人单位和职工共同缴纳基本养老保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加基本养老保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加基本养老保险，由个人缴纳基本养老保险费。公务员和参照公务员法管理的工作人员养老保险的办法由国务院规定。

《《中华人民共和国社会保险法》》第二十三条

职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。